组间差异检验综述

    2022-06-18

    组间差异检验,就是组间的差异分析以及显著性检验。通过应用统计学上的假设检验方法,检验组间是否有差异。所有的差异检验都基于一个假设:组间没有差异,变量之间没有关系(即原假设,H_0)。

    那么什么时候使用参数检验,什么时候使用非参数检验呢?

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    对多变量数据进行回归分析

    2022-06-18

    对数据框的多变量数据,进行 regression analysis时,经常需要对每个变量分别做regression 分析。需要写一个loop,实现办法就是,先构建好formula的字符串,然后使用as.formula() 函数将字符串转化成formula即可在拟合函数中使...

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    富集分析中的超几何分布

    2022-06-18

    当我们从测序数据中得到了一系列的基因后,我们需要研究这些基因都属于那些通路,那些通路是跟我们研究课题相关的。为了解决这一问题,最常用的做法就是做通路注释然后做通路富集分析,看看我们得到的基因都分布在哪些通路。 超几何分布是富集分析的常用方法,常用的GO富集分析都是用超几何分布计算的。下面将浅显的探讨一下超几何分布的原理。

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    创建一个R package

    2022-06-18

    有时候你写了一些函数,想把这些函数打包发布在网上,以便在随时随地都可以通过安装加载package来使用这些函数,这时选择创建一个R包十分理想。

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